empresa simples nacional desenquadrada no Estado

Preciso de ajuda: uma empresa que esta no simples nacional estourou o limite do simples no ambito estadual, e agora me passaram a lei que a empresa pode permanecer no simples, porem no estado fica desenquadrado e recolhendo a parte do ICMS por fora. Isso pode acontecer realmente ?
 Se pode acontecer como fica a apuracao do ICMS ST nesse caso? e a apuracao do icms proprio fica igual o presumido?

Olá Valeria Cristina Estrada de Oliveira