Operação Triangular

Uma farmácia de manipulação com o CNAE 47.71-7-02 vai receber matéria prima para fabricar álcool em gel e retornar para o fornecedor o produto pronto. Nesse caso essa farmácia pode fazer esse procedimento? Uma farmácia de manipulação pode fazer beneficiamento e se enquadrar como Industria? Sendo Optante pelo Simples Nacional tem algo que impeça?
Álcool em gel tem algum beneficio fiscal na parte Federal?
Como devo proceder com a emissão da nota?

Este procedimento é sim de indústria e precisa ser atribuído um novo CNAE na Receita Federal.
O álcool em gel está na Substituição Tributária e empresas do SN podem sim ter produtos com ST e fazer industrialização por encomenda.
Quanto as notas, vc receberá a MP como 5.901, devolverá a mesma nota no 5.902 e emitirá sua nota de industrialização no 5.124, não se utilize de CFOP com ST nesta fase.