Ocimar, bom dia!
No meu entendimento, nesse caso a nota fiscal de entrada de emissão própria foi emitida corretamente, pois apesar do destinatário da nota fiscal ser o seu cliente, repare que no campo de destinatário da nota fiscal, o campo é descrito como destinatário/remetente, ou seja, seu cliente apenas emitiu a nota fiscal de entrada em nome do cliente dele, não vejo necessidade de cancelamento da nota fiscal tampouco outro meio de retificação desta, pois dessa forma lê-se na nota fiscal que o remetente seria o cliente e o destinatário o emitente.
Emitente é aquele que emite a nota, mas nem sempre ele será o remetente, aquele que envia a mercadoria/produto, no caso, seu cliente foi o destinatário, e destacou corretamente que o remetente foi o cliente dele.
Caso minha interpretação esteja inadequada/incorreta, solicito aos demais colegas com maior expertise um esclarecimento a respeito.