forma de tributação

Bom dia, estou com uma dúvida vou abrir uma empresa apuração pelo lucro presumido  aqui em São Paulo, da seguinte forma e preciso da ajuda de vocês.
A empresa ira revender ônibus, vans e etc.. novos a princípio, o que acontece é a seguinte questão: Ela irá comprar o chassi, mandar colocar carroceria, bancos e etc, para efeito de base de calculo de pis e cofins será (aquisição + industrialização = custo) minha revenda será (custo + margem= valor da venda) neste caso minha base de calculo seria valor da venda - custo? estou procurando informações inclusive nas instruções normativas  e leis da RFB não encontrei nada conclusivo, se me ajudarem ficarei grato 

Bom Dia Eduardo,

Primeiramente diga qual o regime tributário da empresa, SIMPLES, REAL ou PRESUMIDO?
Pelo que entendi sua dúvida é sobre a margem de lucro?
Ou seria a base de cálculo de algum imposto?

Abç