RETENÇÕES FEDERAIS X ADMINISTRAÇÃO PÚBLICA FEDERAL

Boa tarde! 
Gostaria de uma ajuda.

Minha empresa presta serviço (lucro presumido) para um Banco com administração púbica federal. Estou com algumas dúvidas em relação as retenções a pagar.
Em outubro tivemos 2 notas emitidas no dia 06, porém seu pagamento só foi efetivado no dia 03/11. Na nota fazemos as retenções de:
PIS 0,65%
COFINS 3%
CSLL 1%
IR 4.8%

Gostaria de saber se devido ao pagamento ter sido feito no mês seguinte à emissão da NF, eu, prestador, tenho que pagar os DARF's de PIS, COFINS e CSLL referente a nota emitida em outubro, uma vez que o tomador pagou a mesma com os devidos descontos das retenções. 
Nos meses seguintes tivemos os pagamentos  feitos dentro do mês de emissão da NF. 
A CSLL eu pago trimestralmente o restante que não é retido na NF.