Compensação de empresa do Simples Nacional com matriz e filial.

Boa noite pessoal, tudo bem?
uma empresa do simples nacional atuou desde 2017 com a matriz, em 2019 abriu uma filial, fazendo a o lançamento de matriz e filial dentro da mesma declaração de maneira adequada.
No entanto a matriz acabou pagando tributos federais em duplicidade, realizamos a retificação e para nossa surpresa o crédito não aparceu, aguardamos uma semana e nada, o que pode ter acontecido com este crédito? Possuo procuração apenas do cnpj da filial, mas como a declaração é conjunta não deveria aparecer? Devo fazer o trabalho de compensação da matriz pela procuração da matriz e o da filial pela filial? Posso usar o crédito de uma para abater os débitos da outra?

Declarações de tributos federais não são feitas por matriz e filiais, são todas reportadas pela matriz. O que vocÊ chama de duplicidade? Se as declarações são únicas, obviamente vocÊ pagou imposto 2 vezes é isso? Se foi, peça uma restituição de imposto paga em duplicidade ou se utilize de uma PerDcomp.