Transferência de estoque de matriz para filial

Prezados, bom dia!

Preciso fazer a transferência de estoque entre a matriz que é indústria, comercio e serviço, para a filial que é comercio varejista. Como no comercio não faço o recolhimento do IPI, caso faça a transferência a preço de custo do estoque, o valor pago pela matriz do IPI passa a ser menor.

Minha duvida é: Posso fazer a transferência da mercadoria a preço de custo ou devo fazer a preço de venda?