Erro no anexo nos fechamentos do simples nacional

Boa noite, fui verificar minha funcionária está fechando a um ano uma empresa do simples nacional no anexo 4 pagando o Iss no simples, porém a empresa é do anexo 3 e não paga o Iss no simples pq já fez o recolhimento nas notas fiscais.  O iss foi pago duas vezes, como proceder nesse caso! Tenho q retificar as declarações no anexo correto e solicitar restituição ao município?