Sem Fins Lucrativos - Impostos Federais

Em relação a uma PJ sem fins lucrativos. Até hoje ela apenas tinha como "Receita" as contribuições dos associados. A partir de hoje ela terá uma "Receita" extraordinária. Ela terá que emitir 1 NF de venda para a Prefeitura em relação a fornecimento de produtos da merenda escolar. Por exemplo: o associado X emite 1 NF de Produtor para a Associação no valor de R$ 1.000,00 referente a seus produtos. A Associação emite 1 NF de R$ 1.000,00 para a Prefeitura e recebe da Prefeitura. Depois ela simplesmente repassa esses 1.000,00 para o associado. Simplesmente a Associação irá fazer essa intermediação, pois essa relação tem que ser entre Prefeitura e Associação. Essa NF emitida pela Associação deverá sofrer algum tipo de Tributação referente a impostos federais? Desde de já, Obrigado!