Obrigações da empresa Pós Incorporação.

Boa Tarde! 

Estamos precisando muito de ajuda.. 

Foi feito á Incorporação de um CNPJ aqui em uma empresa, estamos com duvidas referente esse incorporação. 
O que devemos informar do antigo CNPJ referente aos colaboradores as obrigatoriedades mensais e anuais de uma empresa. 
Tem um colaborador que foi envido de forma errada na SEFIP desse antigo CNPJ antes dessa incorporação, tem como retificar? Tendo em vista que este Certificado digital dessa empresa não existe mais. 
Estamos com muitas duvidas. 

Desde já agradeço.