GPS de autonomo em trabalhador rural

Boa tarde!

Tenho a seguinte situação : Uma empresa que é Trabalhador rural cujo o mesmo possui a matrícula CEI. Tenho cadastrado em meu sistema apenas 1 funcionário e 1 autônomo,este sendo o contador.

Ao gerar a GPS devo recolher o INSS do autônomo? Já que este é uma pessoa física que está prestando serviço para outra pessoa física. Ou não? e apenas recolher os 20% sobre o valor do serviço prestado?

Estou com essa dúvida,se alguém souber ficarei grato.

Att.