Bruno Machado,
Segundo o Manual, terás de reabrir o movimento, corrigir, e depois emitir uma nova DAE, abatendo os valores pagos:
O empregador poderá reabrir a folha de pagamentos para alteração nos valores das remunerações e da data de pagamento dos salários. Para isso, deverá clicar no menu de "Folha/Recebimentos e Pagamentos", clicar sobre a competência desejada e clicar no botão "Reabrir Folha de Pagamentos".
Após a reabertura da folha de pagamentos, será necessário encerrá-la novamente e gerar a guia única. O abatimento de guias que já foram pagas deverá ser efetuado manualmente pelo usuário, marcando apenas os tributos ou editando os valores que deseja recolher, conforme item 4.3.1 "Alteração Manual dos Valores da Guia Única - DAE" deste Manual.