Jornada de trabalho - Horas faltas descontadas

Bom dia;
Tenho um cliente no escritório na seguinte situação, se trata de uma Panificadora das quais as balconistas trabalham 7:20 hr durante 6 dias da semana, com folga fixa conforme escala.
O que tem ocorrido é que, instruí ao cliente qual o horário deveria ser seguido para atingir as 7:20 hr diárias, inclusive com o intervalo de 1 hora para alimentação, mas o cliente fez uma escala de horários de acordo com a necessidade da empresa, a qual não atinge as 7:20 hr, geralmente fica entre 6:30 hr diariamente.

O que tenho feito é descontar as horas faltas em folha de pagamentos conforme o ponto eletrônico das funcionárias, porém isso se tornou rotineiro (3 meses) e antes de ter algum problema, busco uma ajuda de vocês á respeito, se existe algum impedimento na CLT para isso;

Uma observação é que antes da jornada de 7:20 hr diárias, todas as balconistas eram registradas com 180 horas (6 horas por dia), porém o Sindicato da categoria fez o pedido formal de alteração na jornada de 180 para 220 horas.

Jam um bom dia!

Essa pratica traz prejuízo para os trabalhadores, visto que por mais que não teja atividade apos o cumprimento das 6hs e 20 min na empresa os trabalhadores estão a disposição da empresa e se a empresa que libera a todos para ir embora não tem o que se falar em descontos.

Essa pratica poderá acarretar em reclamatória trabalhista no futuro.