Comunicação indevida de auxilio doença

Boa tarde colegas,
Tenho uma dúvida quanto a gfip e fechamento do salário na seguinte situação: Afastamento de "novo afastamento mesma doença" 15/05/2017 à 23/05/2017 o que não gera os 15 dias para empresa pagar, desconta automático. Como neste caso ocorre que a pericia só seria realizada no mês seguinte. Informei de fato, o afastamento, pois é o que ocorreu. Ao realizar a pericia no mês subsequente este afastamento foi negado pelo perito do inss onde as horas em folha 05/2017 descontadas devem ser pagas, momento que o beneficio foi negado. Sempre fico em dúvida no seguinte: Tenho que refazer a folha, excluir o afastamento por consequencia o desconto das horas afastadas o que gera inss e fgts a pagar (diferença com correção) e após enviar gfip, OU há outra forma de ser feito sem que fique gerando multas e juros para a empresa. De que forma procedem nestas situações?

Evelyn, se ela não trabalhou enquanto esperava a pericia por que vai pagar?

Oi Lucidia,
Porque tinha atestado, por isso foi encaminhado a pericia mesma doença.