Socorro .....Boa tarde , se eu registar uma pessoa como Lider de Balconista , preciso colocar destacado no registro os 40 % de cargo de confiança  ou posso registar com um salario maior sem descriminar este percentual?

Boa tarde Lucimari.
Deve ser anotado em CTPS sim, o salário + o adicional de cargo de confiança. 
Mas verifique se é realmente necessário este pagamento, pois este adicional é pago para os cargos de gerência, e ao meu ver um lider de setor ainda tem um gerente acima dele para se reportar de acordo com hierarquia de cargos, então verifica direitinho a posição que ele ocupa na empresa para não ter problemas futuros, tanto com pagamentos como de classificação do cargo.