Vamos lá Caro Fabiano o lance é muito simples se você sair conforme a primeira hipótese irei aqui se referir só aos reflexos de férias visto que não irá ter muita mudança os saldos de salários, certo? Aviso trabalhado com uma férias vencida e outra para vencer você teria, R$ 990,00 (Férias Vencidas) + R$ 990,00 (Férias Em Dobro) + R$ 990,00 (1 Férias Período) + R$ 990,00 (1/3 sob as Férias) totalizando R$ 3.960,00. Na segunda hipótese iria mudar a ordem das coisas e uma diferença do 1/3 sob as férias, vejamos Aviso Indenizado R$ 990,00 + R$ 82,50 (1 Mês Férias- Indenizadas) + R$ 82,50 (1 Mês 13º Indenizadas) + R$ 990,00 00 (1 Férias Período) + R$ 357,50 (1/3 sob as Férias ) totalizando Sub R$ 2.502,50 com a negociação das férias que será retroativa acrescenta-se R$ 990,00 (Férias Vencidas Acordo Retroativo) + R$ 330,00 (1/3 Sob as Férias) total geral agora R$ 3.822,50 – diferença bruta R$ 137,50 sendo que tem o INSS sob as férias que vai diminuir isso no acordo o desconto do INSS será de R$ 118,80 (9%) então diminuirá ai para R$ 3.703,70 por outro lado no entanto vejamos o seu saldo de FGTS que irá aumentar R$ 198,00(juntado Aviso Indenizado e Férias retroativas que será depositado) logo teremos R$ 3.901,70 no final do muidos, vale ressaltar que esses valores viram separadamente no final de tudo que vai-se ter essa diferença viu, bom ao fim a diferença será de R$ 58,30 caso você ache necessário brigar ou fazer questão por esse valor, no mais é isso espero que você tenha entendido, a empresa ta economizando esse valor e ta gerando mais trabalho para ela elaborando as guias para pagamentos, papel, tempo e toda o remanejo de datas, vale também levar em consideração o valor que vai ser acertado as suas férias retroativas que não pode ser menor que o valor do salário atual, mesmo que seja feito o acordo com a o valor antigo, você vai pelo valor atual. Bom amigo penso que é só isso, você soma o saldo de salário que vai ter mais ou menos seu valor cheio depois dos descontos...
Espero ter ajudado e te digo você não sairá na desvantagem
Att
Robert Sodré