Liberação do FGTS de funcionário transferido

Boa tarde, galera. Estou com a seguinte situação:
Um funcionário foi registrado em 01/07/2021 em uma empresa matriz, e em 01/04/2020 foi transferido para uma filial, ficam na mesma cidade e o cargo do funcionário continuou o mesmo.
A questão é, agora o funcionário foi dispensado sem justa causa, então será necessário fazer a liberação do FGTS. Como que é feita essa liberação? Será necessário liberar separadamente o que está na conta da matriz e o que está na conta da filial? E o recolhimento da multa? Deve recolher 40% do que está na conta da matriz em uma guia e 40% do que está na conta da filial em outra guia? Ou soma tudo e faz uma guia só? 

Agradeço desde já, tenham uma ótima tarde. 

Boa tarde

Sendo uma transferência entre filiais da mesma empresa ele não deveria gerar 2 contas diferentes, fica com a mesma conta de fundo no FGTS, chegou a gerar o extrato no conectividade social já?

Conrado,

Quando ele foi transferido, deveria ter sido feita a transferência da conta dele no FGTS.

Em uma situação dessas, há muito tempo, o sindicato (para efeitos de homologação) em vista do não processamento da CEF da transferência, aceitou que eu gerasse as duas chaves em favor do empregado.

Uélinton Azeredo ainda não gerei o extrato no conectividade social, pois o empregador não possui certificado, nem da matriz e nem da filial. Estou tentando entender como funciona nessa situação exatamente para ver se o mesmo precisa fazer o certificado digital da matriz e filial ou só da filial. 

Eurus Christian Bahniuk e conseguiu gerar as duas chaves sem problema algum? Na hora do mesmo ir sacar não deu nenhum problema?