Emissão de nota fiscal por funcionário MEI

Boa tarde!
Estou tendo uma situação aqui, a qual não estou achando que esta sendo bem orientada:
O funcionário registrado (CLT), vendedor ou gerente comercial, pode emitir nota fiscal como MEI para recebimento das suas comissões pelas suas vendas?
Esta correto este procedimento, pois como o mesmo esta registrado para essa função, não haveria de ser lançado em folha de pagamento essas comissões?

Se fizer isso, abrirá precedentes para passivos judiciais. Não faça.

Boa Tarde Caros Colegas!!!

Estou com uma dúvida, um Empresário Individual será registrado por uma empresa como representante comercial e terá um salário fixo, que na verdade esse salário é referente aos custos com alimentação e transporte. As comissões será emitida uma Nota Fiscal para que o pagamento seja feito, isso é permitido? 

Grata, desde já. 

Angela.