Certidão Negativa de empresa com pendencias

Boa tarde colegas!

Tem uma empresa que nos envia suas certidões negativas todo mês, para poder receber suas notas fiscais. Porém essa empresa nos fornece funcionários para função de Limpeza, e os funcionários relatou que a empresa não está depositando o FGTS e INSS para eles. 

Como uma empresa que não está depositando FGTS e INSS para os funcionários consegue ter certidões negativas?? Alguém consegue me explicar isso?? 

Olá, bom dia! Nas certidões tem um link para consultar autenticidade dos documentos. Ademais, você mesma pode verificar o documento, exemplo a CND Federal, você emite direto pelo site da Receita Federal com o CNPJ da empresa. Se a certidão sair normalmente, está recolhendo o INSS (mesmo que parcelado etc). Ademais, uma certidão federal tem validade de 90 dias se não me engano. 
Quanto a certidão do FGTS, mesmo que a empresa não esteja recolhendo o valor mensalmente, ela sai negativa (não sei pq kkk). Acredito que com o FGTS Digital isso vai mudar.