admissão de funcionários

Boa tarde amigos, tenho uma dúvida em relação aos funcionários de uma empresa de construção civil, é correto assinar as carteiras de trabalho, com o cnpj da empresa, ou obrigatoriamente tem que assinar no cei de cada obra,pois aqui no meu estado o sindicato diz que tanto faz, mas o inss não ver assim, diz o auditor que tem que ser no cei de cada obra?

Segundo instrução de um auditor aqui na Bahia o registro na carteira e escrituação no livro deve ser feito no CNPJ se o CEI for vinculado ao mesmo.Caso o CEI nao seja vinculado, ai sim a admissao deve ser feita em separado.