Nfce Legislação

Boa tarde!
Aconteceu um fato seguinte: uma empresa começou a emitir NFC-e, com a série 2 em agosto de 2014.
Já emitia antes disso NFe com a série 1.
Em dezembro, começaram a emitir NFCe série 3 em um caixa diferente.
O pessoal do sistema diz que a série é por caixa.
Como procedo nessa situação, visto que meu entendimento seria todos os caixas utilizarem a mesma séria até chegar a nota 999.999, para só então ir para a série 3.
Qual a Legislação onde se refere isto?