Manifestação do destinatário em Nota fiscal de SERVIÇO em Sã

Bom dia senhores,

Preciso do auxílio, alguém já teve alguma experiência onde teve que recusar uma nota fiscal de serviço?

A minha situação é a seguinte. A empresa Mercado Eletrônico de São Paulo/SP emitiu uma nota fiscal de serviço contra nosso CNPJ alegando que efetuamos a contratação de um sistema online, porém não houve nenhum email de confirmação ou aviso desta contratação. Em contato com a empresa fui informado que o cancelamento da NFSe e da fatura gerada seria feito, porém já se passaram 20 dias, sem retorno e nada resolvido.
Pensando no futuro e tentando minimizar a dor de cabeça que isso pode gerar, gostaria de saber se a prefeitura de São Paulo permite a manifestação do destinatário e informar o "desconhecimento da operação", assim como é possível fazer com notas fiscais de produtos utilizando o aplicativo de manifestação do destinatário(https://www.fazenda.sp.gov.br/nfe/manifestacao/manifestacao.asp).