Maria Paula,
No seu caso, foi exposto o seguinte:
não tem as notas fiscais referentes as despesas com a construção da casa
Se ele não tem as Notas Fiscais da construção da casa, ele está com um "passivo tributário" junto com a Receita Federal, além de ele estar contribuindo para a sonegação de impostos (ele não exigiu a NF da empresa que comprou os materiais e esta empresa não pagou os impostos e nem contabilizou a venda, o que caracteriza o "caixa 2").
Este seu caso é bastante complicado. Seu cliente não tem como comprovar o valor gasto com a compra/construção da casa. Se ele chegar a vendê-la, terá que recolher o imposto sobre o
ganho de capital. O que o seu cliente fez ao não exigir as Notas Fiscais de compra dos materiais foi "pegar para ele" a responsabilidade de recolhimento do IR.
Provavelmente seu cliente terá apenas como bem o lote de terreno. Ele deverá lançar apenas o lote de terreno com o valor de sua aquisição.