Inutilização de nota fiscal que tenha MDF-e AUTORIZADO.

Pessoal bom dia tudo bem?
Trabalho com uma Industria, que precisa cancelar ou inutilizar uma NFE enviada para o MT.
Porem, essa nota tem MDF-e e só pode ser cancelada depois que esse manifesto for cancelado. Entramos em contato com a empresa emitente do manifesto , e os mesmos informaram que não conseguem mais fazer o cancelamento do MDF-e devido a mercadoria já ter saído do estado etc....deram umas explicações.

Nosso cliente, quer saber, se tem como INUTILIZAR essa nota,estando com o MDF-e autorizado, ou se também não é possível.

Se vocês puderem me ajudar nessa questão eu agradeço.

Obrigada.