Registro de Trabalho Incorreto?

Boa Tarde!
Gostaria de um esclarecimento.
Trabalho em uma Clínica Médica, fazendo o faturamento dos convênios médicos que a clínica atende, 6 funcionárias são registradas pelo CNPJ da Clínica que é do sindicato da saúde, porém eu e outra funcionária fomos registradas por outro CNPJ dos mesmos socios mas que pertence ao sindividro, não prestamos nenhum serviço referente a essa empresa, tudo o que fazemos está relacionado ao trabalho da clínica, inclusive usamos o uniforme da clínica, agora fomos falar com o RH e eles disseram que irão cancelar esse registro e passar para o registro da clínica e que não precisa ser feito rescisão, mas como fica o meu FGTS, ja sou registrada ha 2 anos, e se eles me demitem depois de alguns meses, como fica??
Grata,
Angélica

Angelica, boa tarde.
Nesse caso e feito uma ressalva na sua CTPS, e o rh irá providenciar correção nos demais orgãos (inss/cef/m.trabalho, etc...)