O bom seria,
a) conseguir uma copia da RAIS junto ao M.Trabalho, ele vai até uma agência do M.Trabalho junto com a CTPS e requerer uma copia autenticada da Rais referente aos anos em que trabalhou;
b) conseguir copia do extrato Analitico do FGTS, ou na CEF ou pela Internet, https://www.caixa.gov.br, trabalhadores, fgts, extrato de fgts, depois irá cadastrar uma senha, e voltar ao sistema digitar novamente o pis e depois a senha, e ir ao EXTRATO COMPLETO.
c) ou ir ao sindicato onde irão fornecer algum documento que prove que ele trabalhou nesta empresa
depois com o(s) documento(s) em mãos ir até a INSS para que eles possam registrar.
A CTPS com baixa se não tiver algum documento que prove dificilmente o INSS irá reconhecer, então terá que ingressar na Justiça Federal através de um advogado previdenciário para que a mesma reconheça o vinculo.