Baixa na CTPS com Férias indenizadas na Rescisão

Bom dia, gostaria de saber se quando um funcionário tem 12 meses completo de trabalho e pede demissão, as férias seráo indenizadas na rescisão, mas e a baixa na CTPS, os dias serão projetados?

Bom dia Rogério, voce dar baixa na CTPS com a data do pedido de demissão e na TRCT vc paga as férias do funcionario.

Entendi, é normalmente o que se faz, mas não acho certo, uma vez que o funcionario teria o direito a gozar as ferias com o salario mais os acrécimo, e no caso quando ele voltasse, ainda teria na rescisão o mais 1 avos de ferias proporciaonais e mais 1 avos de 13°, sendo assim ele fica no prejuiso mesmo, mas e se fosse diferente, tivesse sido dispensado sem justa causa, seria a mesma coisa?

Sim, a unica diferença é o seu FGTS que fica retido.